Vid midsommar 1734 reser Petrus till Stockholm för att be sina svågrar om pengar för att finansiera en utlandsvistelse. I september avreser han från Stockholm till England och anländer till London november, där han träffar Hans Sloane. I juni 1735 lämnar han London och åker till Holland, vill promovera sig till medicine doktor. Den 27 juni träffas Petrus och Linné i Leyden, Petrus har slut på pengar. Linné sammanför honom med Albert Seba, en förmögen apotekare som håller på att avbilda sina zoologiska samlingar. Petrus skall, mot ett arvode, skriva om fiskarna. Den 27 september går Petrus på fest hos Seba, på väg hem drunknar han i en av Amsterdams kanaler. Dagen efter hittar man hittar man kroppen. Söndag 2 oktober begravs Petrus på S:t Anthonis kyrkogård.

1738 trycks Petrus stora manuskript, Ichthyologia, i Leyden, av Linné.

28 juni 1905 avtäcks en minnessten i Amsterdams zoologiska trädgård.

"Artedi är en av de stora gåtorna i svensk vetenskapshistoria, okänd till person och tankevärld så när som på sitt huvudarbete, den av vännen Carl von Linné utgivna Ichthyologia. (…) Hans betydelse för iktyologin som systematiker och metodskapare är mycket stor. Han teoretiska medvetenhet gör frågan motiverad om i vad mån Linné stod i beroende till den något äldre kollegan. (…) Vid sin bortgång levde han i fattigdom men stod av allt att döma inför sitt internationella genombrott som vetenskapsman."